La Société  Africaines Francophone d’Ophtalmologie a pour socle les Sociétés nationales de chacun des pays membres.

La Société nationale de chaque pays désigné pour abriter le congrès propose en son sein, un membre généralement le Président pour assurer la présidence de la S.A.F.O durant la période de deux années entre deux congrès et aboutissant au congrès que le pays en question doit abriter.

Durant cette période, la Société nationale en collaboration avec le Secrétariat permanent met en place les mécanismes et les méthodes nécessaires pour la bonne réussite de la S.A.F.O.

A l’issue du congrès et avec la confirmation du pays devant abriter le prochain, le nouveau président est désigné